Une immense soucoupe volante envahit le ciel terrestre, libérant un nombre infini de plus petites soucoupes qui prennent position au-dessus des plus grandes villes du monde. Un informaticien new-yorkais décrypte les signaux émanant des étranges voyageurs. Ils ne sont pas du tout amicaux et ces extraterrestres se préparent à attaquer la Terre.
La nouvelle aventure d’Indiana Jones débute dans un désert du sud‐ouest des États‐Unis. Nous sommes en 1957, en pleine guerre froide. Indy et son copain Mac viennent tout juste d’échapper à une bande d’agents soviétiques à la recherche d’une mystérieuse relique surgie du fond des temps. De retour au Marshall College, le Professeur Jones apprend une très mauvaise nouvelle : ses récentes activités l’ont rendu suspect aux yeux du gouvernement américain. Le doyen Stanforth, qui est aussi un proche ami, se voit contraint de le licencier. À la sortie de la ville, Indiana fait la connaissance d’un jeune motard rebelle, Mutt, qui lui fait une proposition inattendue.
Depuis 60 ans, Paul, un extraterrestre, vit sur terre et collabore avec le gouvernement américain. Il se cache à l'abri des regards dans une base militaire ultra secrète... Paul est à l'origine de tout ce qu’on a pu imaginer sur les extraterrestres, du merchandising aux scénarios de Rencontres du troisième type , E.T. ou encore X Files. Hélas pour lui, maintenant que le gouvernement américain lui a soutiré toutes les informations intéressantes sur la vie extraterrestre, il décide de se débarrasser de lui. Paul réussit alors à s'échapper et tombe nez à nez avec deux adolescents attardés fans de science-fiction qui sillonnent les États-Unis en camping car. Paul les convainc de l'emmener avec eux et de l'aider à quitter la terre. La tâche s’avère d'autant plus difficile pour nos deux "héros du dimanche" qu'ils sont poursuivis par un flic implacable assisté de deux pieds nickelés du FBI...
Dans un endroit perdu du Mississipi, deux adolescents assistent, médusés, au crash de deux vaisseaux spatiaux d'où ne tardent pas à s'extraire deux créatures extraterrestres. Il s'agit de deux ennemis jurés qui se livrent une bataille sans merci pour la possession d'un artefact au pouvoir inestimable. Leur combat va les mener jusqu'à une base militaire dont les occupants n'ont jamais eu à affronter une puissance aussi dévastatrice...
Trois adolescents curieux pénètrent dans la mystérieuse zone 51, une base de l'armée de l'air américaine perdue dans le désert du Nevada.
Des pressions de l'opinion publique américaine obligent le gouvernement à fournir à quelques journalistes des informations sur la fameuse et mystérieuse zone 51. Ceux-ci pourront également avoir un accès limité sur place. Mais leur visite va réveiller un résident de longue date de la zone, et les plonger dans la terreur.