Pendant la deuxième Guerre Mondiale, 40 000 sous-mariniers allemands envoyés par Hitler embarquent pour une mission de routine dans l'Atlantique Nord. L'insouciance règne à bord. Ce qu'ils ne savent pas, c'est que seuls 10 000 hommes retourneront chez eux vivants.
Le sous-marin nucléaire soviétique "K219" patrouille dans les eaux internationales de l'océan Atlantique avec à bord seize missiles pointes vers les États-Unis. Un sous-marin américain le détecte et commence à le prendre en chasse. Le commandant russe fait effectuer une manoeuvre périlleuse a son équipage pour affoler les Américains. C'est la collision. Le feu se déclare a bord du sous-marin soviétique. Pour les équipages des deux navires, commence alors une bataille contre le désastre qui risque de s'abattre sur les plus grandes villes des États-Unis.
Jordan O'Neil, lieutenant dans la section renseignement de la marine, aspire à gravir les échelons de la hiérarchie militaire et rêve d'eêtre affectée dans une unité combattante. Seulement c'est une femme et le sexisme est de règle dans l'armée americaine. Grâce à l'appui interessé du senateur Lillian DeHaven, elle rejoint le corps d'élite des Seals pour y passer les tests d'incorporation. Plus que les marches forcées et les insultes, le combat qu'elle va devoir livrer contre la jalousie, les trahisons et les interêts politiques est un véritable défi.
En 1942, les États-Unis viennent d'entrer en guerre contre les forces de l'Axe. Le capitaine Mike Dahlgren commande le S-33, un sous-marin archaïque mais redoutable. À son bord se trouvent les lieutenants Andrew Tyler et Emmett, l'enseigne de vaisseau Klough, Wassner et d'autres hommes d'équipage, engagés dans une mission décisive. Le S-33 va être maquillé en sous-marin allemand, l'un des célèbres U-Boot qui patrouillent au fond de l'océan. La réussite de leur mission va dépendre désormais de leur solidarité, de leur rapidité et de leur courage.
Lorsque la journaliste Kim Wall disparaît après être montée à bord du sous-marin de l'inventeur Peter Madsen, les explications confuses de ce dernier laissent présager le pire.
Au début de la Seconde Guerre mondiale, Salvatore Todaro commande le sous-marin Cappellini de la Royal Navy italienne. Par une nuit noire d'octobre 1940, alors qu'il navigue dans l'Atlantique, il tombe sur un navire marchand armé naviguant toutes lumières éteintes. Il tire ses canons sur le navire et le coule. Ensuite, le Commandant prend une décision destinée à entrer dans l'histoire : il sauve les 26 Belges naufragés qui autrement se seraient noyés au milieu de l'océan et les débarque au port sûr le plus proche, comme le prescrit le droit de la mer. Pour leur faire place à bord de son sous-marin, il est contraint de naviguer à la surface de l'eau pendant trois jours, visible des forces ennemies et mettant en danger sa vie et celle de ses hommes.